靶向代謝組學

靶向代謝組學分析主要是以標準品為參照,對特定的代謝物群進行有針對性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術方案包括常規的液質聯用(LC-MS)分析技術和選擇性反應/多反應監測技術(MRM/ SRM)。常規分析法首先利用LC-MS的方法對待分析樣本進行大規模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標準品的分析結果進行比對,實現對樣本內目標代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術是基于已知或假定的反應離子信息,有針對性地選擇數據進行質譜信號采集,對符合規則的離子對進行信號記錄,去除不符合規則離子信號的干擾。定量過程中,該技術首先篩選到目標代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對這些母離子進行碰撞誘導,去除其他離子的干擾,只對選定的特異MS/MS2離子進行質譜信號的采集,從而實現對目標代謝分子更為特異、靈敏、準確的分析。


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靶向定量代謝組學技術路線

靶向代謝組學

靶向代謝組學

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拜譜生物靶向代謝組學服務內容

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服務項目
物質名稱
種類
能量代謝2-磷酸甘油酸、二羥丙酮磷酸、琥珀酸、延胡索酸40種
氨基酸-20AA天冬酰胺、酪氨酸、賴氨酸、精氨酸、谷氨酸20種
神經遞質谷氨酸、γ-氨基丁酸、多巴胺、腎上腺素17種
動物激素皮質酮、皮質醇、可的松、11-脫氧皮質酮、醛固酮15種
植物激素吲哚-3-乙酸、吲哚-3-乙酸甲酯、吲哚-3-丁酸等20種
葉酸類葉酸、同型半胱氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、維生素B12等7種
犬尿氨酸犬尿氨酸、犬尿喹啉酸、喹啉酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、3-羥基犬尿氨酸等7種
脂溶性維生素Vitamin_A1(Retinol) 、Vitamin D2 、Vitamin D3 、25-OH_Vitamin_D2 等7種
水溶性維生素Vitamin_C (Ascorbic_acid) 、Vitamin_B1 (Thiamine) 、Vitamin_B2 (Riboflavin)、Vitamin_B3 (Nicotinamide)、Vitamin_B5 (Pantothenic_acid)等12種
靶向脂質FFA、LPA、LPC、LPE、LPI、LPG等500種以上
P200代謝物乙?;嚢彼?、D-生物素、單磷酸胞苷、硫胺素焦磷酸、乙酰亮氨酸、羧基丁酸、硫胺素一磷酸鹽等200種
短鏈脂肪酸-GCMS乙酸、丙酸、異丁酸、丁酸、異戊酸、戊酸、己酸7種
中長鏈脂肪酸-GCMS丁酸、辛酸、十三烷酸、γ-亞麻酸、二十碳三烯酸等37種
膽汁酸-GCMS膽酸、別膽石酸、3β-熊去氧膽酸、正膽酸等42種
花生四烯酸花生四烯酸、二十二碳六烯酸、血栓烷B2、前列腺素F2α、白細胞三烯D4等15種
類胡蘿卜素a-胡蘿卜素、β-胡蘿卜素、葉黃素等16
類黃酮芹菜素、芹菜素4`-O-鼠李糖苷、白楊素、木犀草素、櫻花素、木犀草素 O-芥子酰己糖苷、麥黃酮5-O-乙?;禾擒?、兒茶素、表兒茶素,原兒茶酸,表沒食子酸兒茶素等410種以上
花青素錦葵色素3-O-葡糖普,矢車菊素,花翠素,花翠素3-O-葡萄糖苷,天竺葵素,天竺葵色素苷等35種以上
植物次生代謝黃酮類、花青素、酚胺類、植物激素類、生物堿、萜類、羥基肉貴酰、色胺類、奎寧酸類、兒茶素類、維生素、脂質、糖類、有機酸、氨基酸、核苷酸、其他1610種以上
個性化靶向代謝根據客戶需求定制

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靶向代謝組學

能量代謝標準物XIC圖譜


靶向代謝組學

能量代謝物KEGG通路圖

靶向代謝組學

?能量代謝:本檢測方法覆蓋了三羧酸循環、糖酵解途徑和氧化磷酸化過程中的近30個重要代謝物

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代謝組學適用范圍


體液:血清、血漿、尿液、唾液、膝蓋滑液、腦脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、淋巴液、膽汁等

組織:各種動物組織和植物組織

細胞:細胞及細胞培養液等

微生物:大腸桿菌、鏈球菌等

其他:糞便、食糜、腸道內容物等

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應用領域


非靶向代謝物組學結果的驗證

代謝相關生理、病理研究

發酵工藝研究

食品科學與營養學研究

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拜譜生物優勢


1.? 測試種類廣:購買了大批同位素標準品,建立了多種靶向代謝定量的實驗方法。

2.? 項目周期短:通過流程優化,整個項目最快可以30個工作日完成,比市場平均周期短10天以上!

3.? 售后服務到位:售后服務團隊具有豐富的代謝組實驗經驗,更能理解客戶需求!

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樣品要求


樣品類型

推薦樣本量

預處理及保存

組織

>200mg

液氮速凍, -80°C保存。 ?

尿液

>0.3ml

5000×g 4°C 離心30-60min,取上清, -80°C保存。

血清/血漿

>0.3ml

收集好的血清/血漿液氮速凍,-80°C保存。

腦脊液、羊水、膽汁等體液

>0.3ml

1000g-2000g 4°C 離心10min,(或使用0.22μm濾膜過濾),取上清,-80°C保存。

懸浮細胞

>107

離心收集細胞后液氮速凍后-80℃保存。

貼壁細胞

>107

培養好的貼壁細胞保存在1.5ml離心管中,液氮速凍后-80℃保存

細胞上清液

>10ml

1000g 4℃條件下離心3分鐘,取上清,-80°C保存。

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靶向代謝組學建議樣本建議樣本重復數量如下


動物樣本(各種組織、血漿)

每組?≥?6個重復

植物、微生物樣本(葉片、根組織)

每組?≥??3個重復

細胞樣本

每組?≥?3個重復

臨床樣本(血清、尿液、各種組織等)

每組?≥?10例

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應用案例


1.?? Wei R, Li G, et al. High-throughput and multiplexed LC/MS/MRM method for targeted Metabolomics. Anal Chem. 2010; 82(13):5527-33.

2.?? Roberts LD, Souza AL, et al. Targeted metabolomics. Curr Protoc Mol Biol. 2012; Chapter 30:Unit 30.2.1-24.



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